Jak bylo uvedeno, aplikací je míněno aplikování systému flexideo pomocí definice pro konkrétní potřebukonkrétního pracovního týmu či firmy.
Je-li tedy systém flexideo zaváděn pro konkrétní účel, je třeba založit nový soubor aplikace s nastaveními. Jde o soubory *.xcf (Xml Configuration File), které vytvoříte a spravujete pomocí nástrojů ve flexideo replikátor (vytvoření apráce s tímto souborem viz. zde). Vlastní obsah souboru a jednotlivá nastavení určité aplikace jsou předmětem další části. Zde si projdeme založení zcelanové aplikace.
Založení aplikace průvodcem
V základní obrazovce replikátoru nebo již i v rámci jiné otevřené aplikace je volba pro aplikaci novou (viz. obrázek). Při jejím použití budete vyzváni pro použití průvodce. Průvodce není nezbytný,ale jeho funkce mohou nastavení nové aplikace výrazně usnadnit.