Flexideo server s klientskou částí koumunikuje pomocí HTTP a to jak běžnou webovou komunikací tak i výměnou XML a jiných formátů dat. Server každé aplikace flexideo nabízí několik způsobů komunikace. Má vlastní XML komunikační protokol, nabízí možnost komunikace pomocí vystavených webových služeb, ať již aktivních nebo pasivních. Pro přímou interakci s uživatelem slouží webové rozhraní pro intranet a COMEX nebo případně další webová rozhraní. Tato část mapuje zejm. strukturu požadavků a odpovědí zasílaných na server a vracených klientovi vč. příkladů této komunikace. Dále je pak popsán také způsob výskytu a zpracování pomocí spec. vystavených webových služeb jako akcí.