V dalším kroku bude třeba nalistovat dostupnou složku aplikace. Jde o složku, kde budou klíčové soubory aplikace, kterými bude tato určena. Především jde o XDS aplikace (její DNA). Bude zde však ukládána i celá řada dalších důležitých souborů aplikace, při jejichž ztrátě není možné aplikaci dále tvořit stejně, jako nelze dále rozvíjet i běžný software bez jeho zdrojových kódů.
Tato složka nemusí být dostupná serveru aplikace. Dokonce to není většinou ani žádoucí a zdrojové soubory aplikace v ní uložené jsou ponechávány stranou od funkčního serveru dané aplikace.
To ovšem neznamená, že by složka neměla být řádně zálohována a zajištěna i proti ztrátě či úniku dat, jde často o cenné know-how organizace, která aplikaci provozuje.
Mezi další soubory zde ukládané patří také historicky kompletní XDS, zajišťující kontinuitu verzí aplikace. Dále pak mapu a historickou evidenci tvořených DAD, mapování na jiné aplikace, protokoly, šablony a mnohé další soubory vázané k aplikaci.
Samostatná složka verzí
Pokud není zatržena tato volba, pak se do složky aplikace štosují i složky tvořených verzí, které umožňují například návrat k jednotlivým verzím, umožňují mapování rozdílů mezi jednotlivými verzemi, obnovu při narušení serveru atd.V rámci průvodce při volbě hlavní složky aplikace se můžete zatržením volby "složku tvorby verzí zvolit samostatně" rozhodnout, že tvorbu verzí a informace o nich budete skládat v jiné složce, na jiném úložišti a pod. Význam složky verzí viz. další popis.