Jedna flexideo aplikace, tedy jedna XDS definice se svou historií vývoje, může mít několik instancí, klonů. Ty mohou sloužit a z pravidla slouží pro různé účely. Jedna bývá výchozí, ta slouží pro vývoj (implementaci) struktury a logiky dané aplikace, jiná může sloužit pro testy a pak samozřejmě jiná instance také slouží pro vlastní provoz s ostrými daty. Klony více instancí aplikace to ale nekončí, mohou existovat také různě příbuzné aplikace a jejich instance.